​Созданию ФГБУ ГПЗ «Эрзи» предшествовала длительная работа общественности по необходимости его создания, многочисленные научные и научно-публицистические работы различных ученых и общественных деятелей. Большую роль в открытии заповедника сыграл бывший председатель Госкомэкологии Республики Ингушетия. Заслуженный эколог Российской Федерации – Б.У.-Г.Баркинхоев. На основании закона Республики Ингушетия №572-Р от 23.04.1994 г. «Об особо охраняемых природных территориях» было принято Постановление Правительства Республики Ингушетия №326 от 23.09.1999 г. «О создании Государственного природного заповедника «Эрзи». Исходя из этого постановления Правительства Российской Федерации, вышло Постановление №992 от 21.12.2000 г. «Об учреждении государственного природного заповедника «Эрзи». Таким образом, в России был создан сотый Государственный заповедник, который начал функционировать с 2001 г.

 Общая площадь ООПТ составляет – 69366 га, в том числе территория ГПЗ «Эрзи» имеет площадь –35292 га, ФЗ «Ингушский» - площадь составляет – 34074 га.